Набор для выделения циркулирующей бесклеточной ДНК VAMNE MagUltra
N913-00 5 rxns
N913-01 50 rxns
N913-02 100 rxns
Описание продукта
Набор для выделения циркулирующей бесклеточной ДНК VAMNE MagUltra, основанный на технологии очистки с помощью суперпарамагнитных наночастиц, подходит для эффективного выделения бесклеточной ДНК (вкДНК) из 0,2–10 мл сыворотки, 0,2–10 мл плазмы, 2–10 мл мочи и других образцов бесклеточной биологической жидкости. Специально оптимизированный для выделения низкомолекулярных нуклеиновых кислот, этот набор обеспечивает высокую эффективность экстракции, хорошую целостность и надежную воспроизводимость. Он обеспечивает простое и быстрое выделение вкДНК для использования в различных последующих приложениях, таких как количественная ПЦР, секвенирование нового поколения (NGS) и других молекулярных экспериментах. Этот набор совместим с автоматизированными системами экстракции нуклеиновых кислот на основе магнитных стержней, обеспечивая высокопроизводительную экстракцию.
Функции
- Гибкий входной объем : совместим с 0,2–10 мл сыворотки и плазмы, 2–10 мл мочи и другими жидкими образцами, не содержащими клеток
- Эффективное извлечение целевых фрагментов : высокий выход и превосходное извлечение небольших фрагментов с постоянным и надежным качеством для последующего анализа.
- Нетоксично : не содержит токсичных органических растворителей , таких как фенол и хлороформ, и не требует добавления изопропанола.
- Автоматизированный и эффективный : совместим с 24-луночным прибором для экстракции нуклеиновых кислот, что позволяет обрабатывать до 24 образцов всего за 1 час.
Производительность
- Гибкая регулировка входного уровня громкости
Используя Vazyme №N913 и ведущий на рынке продукт Поставщика А, мы извлекли образцы плазмы крови объёмами 0,2, 0,5, 1, 2, 4 и 10 мл. Выход нуклеиновых кислот из экстракта количественно определялся с помощью Qubit, а распределение фрагментов анализировалось с помощью биоанализатора Agilent 2100 (рисунки 1A и 1B). Результаты показали, что Vazyme №N913 обеспечивал сопоставимый выход и качество во всех объёмах исходных образцов по сравнению с продуктом Поставщика А.
Рисунок 1. Сравнение выхода экстракции и профилей пиков между N913 и сопоставимыми продуктами при различных объемах ввода образцов плазмы
Примечание: объем элюирования для входной системы объемом 10 мл в два раза больше, чем для системы объемом 4 мл.
- Эффективное восстановление целевых фрагментов
Для оценки производительности Vazyme #N913 были подготовлены моделированные образцы путем добавления фрагментов дцДНК разных размеров (80 п.н., 170 п.н. и крупных фрагментов геномной ДНК) в 2 мл PBS с конечной концентрацией целевых фрагментов 10 нг/мл. Параллельно для сравнения обрабатывали 2 мл образца плазмы. Vazyme #N913 сравнивали с коммерчески доступными продуктами от Поставщика A, D, F и G с точки зрения очистки целевых фрагментов. Концентрацию очищенных продуктов измеряли с помощью Qubit (рисунки 2 и 3A), а распределение фрагментов анализировали с помощью Agilent 2100 Bioanalyzer (рисунок 3B). Результаты показали, что Vazyme #N913 продемонстрировал превосходное восстановление небольших фрагментов по сравнению с Поставщиками D, F и G и показал результаты, сопоставимые с Поставщиком A. Кроме того, он показал значительно более низкое восстановление нецелевых крупных фрагментов геномной ДНК по сравнению с другими продуктами. Анализ фрагментов подтвердил, что целевая ДНК, очищенная с помощью Vazyme #N913, была эквивалентна или превосходила ДНК других поставщиков, с необнаружимым большим загрязнением геномной ДНК.
Рисунок 2. Сравнительные результаты восстановления фрагментов N913 и сопоставимых продуктов для фрагментов ДНК разных размеров.
Рисунок 3. Сравнительные результаты выхода экстракции и профилей пиков между N913 и аналогичными продуктами с использованием образцов плазмы
- Превосходное качество данных на выходе
Vazyme #N913 сравнивали с ведущими на рынке продуктами (поставщик A, D, F, G) при экстракции из 2 мл образцов плазмы (включая как нормальные, так и гемолизированные образцы). После количественного анализа с помощью Qubit были выполнены работы с набором для подготовки библиотек Vazyme #ND627 и набором адаптеров Vazyme #N321. Полученные библиотеки прошли секвенирование, после чего данные были проанализированы. Результаты показали, что N913 показал сопоставимые результаты с поставщиками A, D, F и G по выходу библиотек, содержанию GC и значениям Q30. С точки зрения частоты дупликации, N913 показал схожие результаты с поставщиком A для нормальных образцов и превзошел поставщиков D, F и G (рисунок 4A). Для гемолизированных образцов N913 продемонстрировал превосходные результаты по сравнению со всеми сравниваемыми поставщиками (рисунок 4B).
Рисунок 4. Сравнение качества последующего секвенирования N913 и конкурирующих продуктов
Примечание: A: Данные о подготовке библиотеки для нормальных образцов (выход библиотеки, частота дублирующих прочтений, содержание GC и значение Q30); B: Данные о подготовке библиотеки для гемолизированных образцов (выход библиотеки, частота дублирующих прочтений, содержание GC и значение Q30)
Компоненты
Хранилище
КОРОБКА 1. Хранить при температуре от 2 до 8 °C и перевозить в пакете со льдом.
КОРОБКА 2. Хранить при температуре 15 ~ 25 °C и транспортировать при комнатной температуре.